錦綸的單元晶格均屬三斜晶系，其原纖之間具有較大的微隙，錦綸色絲并由一些排列不規則的無定形分子所聯系，而原纖維則由高側序度的分子所組成的微原纖堆砌而成；微原纖間可能存在較小的微空隙，并由一些側序度稍差的分子所聯系。
不同錦綸的大分子主鏈都由碳原子和氮原子相連而成。錦綸色絲在碳原子、氮原子上所附著的原子數量很少，并且沒有側基存在，故分子成伸展的平面鋸齒狀，相鄰分子間可借主鏈上的=C=O和=NH生成氫鍵而相互吸引。
常用的錦綸6具有α、β、Υ三種不同晶體，可以形成三種分子鏈排列密度，其中α晶體穩定，密度較高，為1.235g/㏄,而β和Υ晶體不穩定，在一定條件下，可相互轉變。
